خلال العصور المظلمة (450 م إلى 1000 م) بعد سقوط روما، حظرت الكنيسة الكاثوليكية العلاج بالروائح واستخدام الزيوت الأساسية. وانتشرت ممارسة استخدام الأعشاب والزيوت الأساسية لأغراض الشفاء أو العلاج تحت الأرض وكان أي شخص يتم القبض عليه وهو يمتلك هذه العناصر يعاقب بالموت. اعتقدت الكنيسة الكاثوليكية أن المرض هو عقاب من الله وأن ممارسات "الصلاة" و"النزيف" فقط هي التي يمكن أن تشفي المرض. استمر هذا الحظر من قبل الكنيسة لقرون.
إن ما نطلق عليه اليوم اسم العطور تم تطويره في شبه الجزيرة العربية للمساعدة في علاج الإصابات أثناء أوقات الحرب والصراع. وقد تم إدخال هذه العطور إلى أوروبا والمجتمع الغربي من خلال الجنود العائدين من القتال في الحروب الصليبية (1095-1291 م).
بالإضافة إلى الجزيرة العربية، بدأت العديد من الثقافات الأخرى في استخدام الزيوت العطرية كعطور مع مرور الوقت. في الواقع، في أوقات مختلفة من التاريخ، كانت الزيوت العطرية أكثر قيمة من الذهب.
تم تطوير أول عطر (أو كولونيا) قائم على الكحول في عام 1700 في مدينة كولونيا الفرنسية بألمانيا. وقد تم تسميته بشكل مثير للاهتمام "4711". قد تتساءل لماذا يُطلق عليه رقم؟ الإجابة بسيطة حقًا. كان 4711 هو رقم المنزل الذي تم تطوير العطر فيه لأول مرة. سبب وجيه مثل أي سبب آخر، أليس كذلك؟
وهذا يقودنا إلى الجذور الحديثة للعلاج بالروائح العطرية. فقد اكتشف الكيميائي الفرنسي رينيه موريس جاتيفوس ما نعرفه اليوم بالصدفة (كما هي الحال مع أغلب الأشياء الجيدة) في عشرينيات القرن العشرين. ففي أحد الأيام كان جاتيفوس يعمل في مختبره وحرق يده. ولم يكن لديه ما يخفف الحرق به، فسارع إلى وضع يده في وعاء بارد من اللافندر كان موجوداً في المختبر. وقد صُدم من سرعة اختفاء الألم، ثم صُدم لاحقاً من سرعة وقت الشفاء. فابتكر مصطلح "العلاج بالروائح العطرية" لوصف اكتشافه. وهكذا وُلد علم الزيوت العطرية واستخداماتها.